Museum Ubaya menjadi salah satu fungsi layanan Pusat Arsip dan Museum Universitas Surabaya yang merupakan unit pengelola arsip dan aset museum dibawah manajemen Direktorat Perpustakaan Universitas Surabaya (Ubaya). Dibentuk pada tahun 2002 lalu dan Museum Ubaya sendiri berlokasi di kampus Ubaya Tenggilis. Koleksi yang dimilik yaitu arsip dan artefak Cagar Budaya Universitas Surabaya (Ubaya Heritage).